最先出现裂痕的，是那些身处偏远地区、长期面对困境却深感教会回应无力，同时又或多或少接触过白石大学毕业生的底层教士。
所谓天高皇帝远的说法，在布鲁特地区当然也成立，所以从很早开始，这个群体就并未像教会中高层那样，谈“巫师”色变，而是在不少布鲁特白石大学毕业生假作异国来的学者后，变睁一只眼闭一只眼地放任他们参与地方上的慈善性质的知识传播和医疗体系——
强调一下，教会虽然滋生了许多黑暗和腐败，但并非一无是处，地方教会的好坏与否，本质上还是看管理地方教会事务的神职人员，是以不少地区其实还是很不错的，尤其是在不少偏远地区的愚夫愚妇坚信一些更荒谬的、由他们自己臆想出来的邪教时，教会在某种程度上，多次及时地救了不少人，其中包括一些因为各种各样原因而被遗弃的孤儿。
而在这个群体中，实用性，才是他们最先考虑的。
他们的虔诚通常带有善良的底色，倘若帮助穷苦的贫民与他们的虔诚相悖，那么他们大概率是会舍弃自己的虔诚，这是十分难得可贵的精神，也是让教会彻底坍塌的原因。
于是，在发现“魔法”确实好用以后，他们不仅私下开始讨论，如果“魔法”真的能有净化水源、催生作物、治疗一些疾病的力量，那是否意味着它并非绝对的“邪恶”？如果对自然现象有更合理的解释，是否意味着某些教条需要重新审视？
在拯救生命面前，刻板的教义，是否也是可以稍微让让路的？
紧接着，一些对教会内部腐败僵化早已不满、又对“东方知识”充满好奇的中层神职人员，主要以那些出身学者家庭或本身对知识有追求的人为主，也开始产生动摇。
他们或许不认同卢卡斯的全部理念，但“自然与知识协会”展现出的那种开放、理性、致力于探索的学术精神，与教会内部日益严重的派系斗争、思想禁锢和知识垄断形成了鲜明对比。
裂痕最终演变成公开的分裂，导火索是教会高层试图以最严厉的“异端”罪名，审判并处决几位被发现在阅读并讨论《自然与知识月报》（简称《自然报》）的年轻教士。
这一极端的举动非但没能震慑住教会中日益滋生的“异端思想”，反而激起了更广泛的不满和反抗。
一部分教士和信徒坚持传统教义，认为任何偏离都是对光明神父的背叛，卢卡斯及其协会是必须净化的恶魔代言人。
他们聚集在保守派枢机主教周围，保持了“神圣光明教会”的名称，仍是三大派中势力最庞大、占据核心教区最多的一支，但内部也已充满戾气和恐慌。
另一部分则认为，光明神父的荣光或许可以以更包容的方式展现，东方“魔法”所揭示的自然规律，或许也是神父创世法则的一部分，不应盲目排斥。他们主张改革教义，吸纳部分“合理”的自然知识，与“魔法”力量寻求某种共存甚至有限度的合作。这一派自称“天神教”，意在承认可能存在多位“天神”或“天使”，分管不同领域，试图在传统框架内为新的认知寻找神学依据，吸引了不少希望变革又不想完全脱离信仰的中上层人士。
而最小、但也最激进的一派，则从根本上质疑“人格神”的存在。
他们认为，所谓的“神圣之力”和“魔法”，都是宇宙间某种至高伟力的不同表现形式，教会长期以来垄断了对这种力量的解释权和使用权，并掺杂了太多人为的腐败与私欲。他们主张抛弃僵化的教条和教会架构，直接追寻力量与知识的本源，自称“新光明教”。
这一派成员复杂，既有对旧教会彻底失望的理想主义者，也有渴望不受约束地追求力量的冒险家，甚至可能混入了一些别有用心之人，却也是第一个和卢卡斯所代表的自然与知识协会、布鲁特白石大学进行官方正式交流的教会势力。
不过，由于卢卡斯所代表的“巫师”群体势力太过强大，对外实在有些气短的教会，对内就放心大胆地大打出手了——
三大派系之间争吵不休，互相指责对方为“异端”、“叛徒”，在各地教区爆发了零星冲突，抢夺教堂、圣物和信众。
很快，曾经铁板一块的神圣光明教会，如同涨破的气球一样，啪的一声，彻底分裂，并在短短数月间，元气大伤，甚至丢失了不少地区的事实统治权和税收权。
分裂后的教会，陆续也开始通过报纸争夺话语权，只不过除了新神圣光明教仍然怒斥巫师的力量体系为异端外，无论是天神教还是新光明教，都十分克制。
甚至新光明教发行的《新光明月报》一期比一期激进——
当神圣光明教还在以《来自东方的怪物正在南布鲁特蛊惑平民》、《吃人的魔鬼向布鲁特宣战》和《异端们渗透了整个布鲁特地区》等内容为标题时，新光明教已经非常上道地用《卢卡斯于南布鲁特建立怀特城》、《法师卢卡斯成立‘自然与知识协会’》和《伟大的法师卢卡斯与新光明教教皇约翰于卢登城内进行友好洽谈》等颇有舔狗意味的文字作为标题了，连民间风向也为之一转，卢卡斯的形象从可止小儿夜啼变为伟大、慈祥、智慧的长者。
不过，没有最舔狗，只有更舔狗。
在卢卡斯刚和新光明教的教皇约翰谈过如何平衡新光明教和法师之间的关系后，才应邀赶到威尔逊公国的都城卡马森城，卡马森日报立即就发布了新头条——
《备受尊敬的大法师卢卡斯和慕容如烟将于今日抵达他们忠实的卡马森》。