在十年前母亲遭遇离奇事件失踪之后，他就被父亲送往了亲戚那里寄宿，然后一住就是十年。
就在几天前，自己阔别已久的父亲忽然来了一封信，让他来第三新东京市一趟。
随信而来的还有一位漂亮大姐姐的泳装照，照片上以涂鸦的形式写着一些信息，表明她是自己的接头人，叫做葛城美里，还有她的个人联系方式。
但碇真嗣对这些东西完全无感，他只是对接下来的日子感到了一阵茫然。
在亲戚家住的十年，他在生活上并没有受到亏待，喜欢音乐，亲戚也送他去学了音乐，还买了黄金黎明最新款的随身听给他。
只是，亲戚对他再好，碇真嗣心里也明白，那并非是自己的家，十年以来父亲的漠不关心，让碇真嗣有种自己被抛弃的感觉。
因为他在成长的过程中并没有亲情这一元素的参与。
碇真嗣忍不住在想，自己见到自己的父亲之后，会是一种什么样的表情，而自己的父亲又会是一种什么样的态度来面对被他抛弃了十年的自己。
他内心中还是渴望着一些什么的，不然，就不会一个人带着行李来到这第三新东京市了。
“真嗣君，这里！”一个俏丽的女声忽然在车厢里响起，碇真嗣即便是戴着耳机听着歌，也听到了那个呼喊他名字的声音。
没有听到他的回话，那个女生又喊了几句。
虽然碇真嗣不记得那个声音是自己认识的人，但此时也不得不摘下耳机，回应了一句：“我在这里。”
然后没多久，一个穿着很漂亮的女生走了过来，看到碇真嗣之后却是满脸的狐疑，很显然，她并不认识碇真嗣。
“我在这里。”
就在两个人面面相觑的时候，又有一个声音响起，然后一个男生走了过来。
那个男生是碇真嗣想要成为的人，高大、帅气、阳光开朗。
“真嗣君，你在这里。”那个女生笑着迎了过去，然后瞥了一眼碇真嗣，嫌弃地说到：“真是的，分明不是叫他的名字，还主动答应。”
一旁的碇真嗣都羞红了脸，这种事情，谁遇见谁尴尬，尤其是漂亮的同龄女生。
然后他站起来解释到：“那个，我的名字也是真嗣，我以为是叫我的名字。”
“啊，你也叫做真嗣。”高大的男生走了过来，主动向碇真嗣伸出了手：“我的名字，也是叫做真嗣。”
不知道是犹豫还是思考，对方缓了一下才说到：“我叫做圆新二。”
然后两个“シンジ”交换了一下自己的姓名，发现他们的名字写法不同，但是发音是一样的。