除了以上特别出名的景点，蓬莱阁还有澄碧轩，卧碑亭，苏公祠，宾日楼，普照楼，观澜亭，吕祖像亭，感德碑亭这些现有的景点，还有毁掉的景点，如白云宫，镜石亭，多寿亭，松石亭，李公祠，刘公祠，千佛寺，毗庐阁，仲连祠，排云一见牌楼，海峤仙杖牌楼，古仙灵地牌楼，海潮庵，海镜亭等等这些景点都在史书上拥有，但是早已经不知道什么时候被毁了。
其中澄碧轩位于避风亭西北的丹崖临海处，为轩亭建筑，多有文人墨客于此观海、赋诗、作画。水光天色，映室生辉，清静优雅，正宜走笔。
卧碑亭位于蓬莱阁东邻，为轩亭建筑，以亭中有苏轼《海市诗》《书吴道子画后》横幅碑刻得名，亭内另有清代龚葆琛联语碑刻。
苏公祠位于卧碑亭东邻，轩亭建筑，亭额为著名书法家舒同所书；祠原在蓬莱阁前，建于北宋元符年间；清代盐政碑记中记载：“有宋时，苏文忠公，莅任五日即上榷盐书，为民图休息，土人至今祀之，盖非以文章祀，实以治绩也。”祠内有苏轼肖像刻石拓本，内外壁嵌历代刻石二十余方，其中内壁置有苏轼《海市诗》《望海》《观海》手迹和清代书家翁方纲临《海市诗》楷书刻石。
宾日楼亦称望日楼，位于苏公祠东邻，为八角十六柱双层砖木结构楼阁式建筑。楼体八棱，南侧与吕祖殿联为一体；底层外侧明廊，楼内有木梯盘旋而上；二层周匝开圆窗八扇，眼界极阔，可观八面景致，纳八面来风，是观赏海上日出的地方，有“日出扶桑”之景。
普照楼又名灯楼，位于蓬莱阁东北角，旧为夜间行船导航用的标灯，为三层砖木结构，占地面积25平方米，楼体六棱，楼顶斗拱，内设扶梯盘旋而上；顶层木构，六柱支撑如亭状，周匝木扶栏；田横山航标灯塔启用后，灯楼导航功能渐失。
观澜亭位于吕祖殿东庑南端，有亭相连，旧志称“望海亭”，凭栏观海，一望无际，故得名“观澜亭”。临之可眺水城全貌和海滨一线景致。值秋高气爽之夜，于此可见“晚潮新月”之景。
吕祖像亭位于苏公祠东邻，为轩亭木结构建筑，坐南面北，形制小巧，内祀纯阳帝君吕洞宾肖像刻石；亭南面为明万历间李承勋所立石刻，称“吕祖咏海市诗”，楷体。蓬莱阁建筑群旧有吕公亭，有“纯阳洞”匾额，亭内立吕岩像碑，后亭圮，移像碑于今址，重建碑亭。
感德碑亭位于弥陀寺西北，原置于丹崖山腰，为木构八角凉亭，内立万民感德碑，为清康熙年间地方官为颂朝廷普免田赋之德而立；民国初皆毁，建国后修复碑亭并立碑。今存为八角十六柱拱顶飞檐式木石结构，亭内立感德碑。碑高约2.7米，宽约1.3米，南面镌“万寿无疆”四字，北面镌《重立感德碑记》。
至于被毁的白云宫在三清殿南，今仅存山门及院落遗址。据旧志记载，明万历年间已有此建筑，清顺治、道光年间重修，后毁于何年不详。
镜石亭亦称石镜亭，原在天后宫门东，亭内藏石一方，光可鉴人，或传思乡心切者，可于石中见到故里家山；亭久圮，石亦失；今避风亭与澄碧轩之间壁上嵌一方黄石，题为“镜石”，是后人所置，聊以补缺。
多寿亭原在蓬莱阁南，明万历年间知府王云露修建，因为时间长远，也不知道什么时候被毁。
松石亭原在天后宫门西，据传石得之于海岛，古松所化，或谓石乃高句骊石，明万历兵部主事梁之垣得自朝鲜；石可验晴雨，明万历年间巡道阎士选筑台供之，因为时间长远，也不知道什么时候被毁。
李公祠原在弥陀寺中，旧为卫公祠，祀明代都督卫青；清康熙年间改为李公祠，祀直隶、河南、山东总督李荫祖及其子安徽巡抚李炳、其孙登州总兵李树德，因为时间长远，也不知道什么时候被毁。