明确了奇技淫巧和生产工具的区别，朱由检继续道：
“古人以农为本，以工商为末。”
“张居正提出‘厚商而利农’，赵南星认为‘士农工商，生人之本业’。”
“先生又如何看，应当以何为本？”
这番话放在生产工具之后说，明显意有所指。
钱谦益思考之后，当即道：
“臣以为士农工商四民皆本，既要‘厚商而利农’，也要发展工具，提高农业生产。”
“士人则要研究种植方法、作物种子，同样促进农业。”
“四者缺一不可，故而皆可为本。”
这是赵南星思想的继承和发展，钱谦益的学问，到底还是和东林一脉有渊源。
朱由检先前也曾提过这一点，对士农工商四民同等看待。
但是这里面到底要有主次，朱由检道：
“农为国本，这是肯定的。”
“大明现在就是农业文明，农业产值占总产值的九成以上。”
“但是农业潜力有限，垦完荒地、发展到一定程度就见顶，很难再大幅度提升。”
“大明的人口又不断增多，想维持这些人的生活水平不变，需要更高的产值。”
“故而朕把工商产值，列入官员政绩考核标准。”
“现在需要确定的是，农工商三大行业，哪一个是最根本，哪一个放在其次。”
“要排出来顺序，在三个行业冲突时，偏向根本行业。”
这是对传统农本思想的突破，朱由检需要明确，未来把重心放在哪个行业。
钱谦益揣摩皇帝的意思，说道：
“哪个在前，哪个在后，其实早已排好了。”
“就按农工商的顺序。”
“陛下曾说‘无农不稳’，一旦粮食不够吃，是要天下大乱的。”
“故而农业必须是根本，也就是陛下说的第一产业。”
这都是朱由检曾经说过的话，钱谦益这些日子看了又看，如今深有体会。
朱由检自然点头赞赏，说道：
“农业是根本，但是大明的农业水平已经见顶，今后最多缓慢进步，很难大幅提高。”
“所以这个行业，可以作为根基行业，但是不能作为今后一段时间发展的重点。”
“工业和商业之间，先生倾向哪个？”
钱谦益毫不犹豫道：
“当然是工业！”
“百工可以利农，用更好的工具帮助农业发展。”
“工厂生产的货物，也是商业贸易的源泉。”
“故而工业一定要放在商业前面，它是第二产业。”
“朝廷发展工商，重点要放在发展工业。”
这同样也是朱由检的想法，他听钱谦益说的符合自己心意，抚掌赞道：
“‘工作而商行，本末相表里’，这是欧阳修的诗句。”
“工业和商业之间，若是分个本末，要以工业为本。”
“朕在江南建的苏松新区，就是一座以工业为主的城市。”