朱慈烺自然不是朱由崧这样的软骨头，他手中有兵马，又没有依赖群臣救驾，驾驭群臣完全不在话下，如今的安排，既然已经让不少人都得以如愿以偿，也平衡了朝廷的力量，确保了朝局将来一段时间的稳定。
而文官暂时安排妥当，组成了内阁和各部的新班底之后，就轮到了军事上的安排了。
原本历史上的“江北四镇”，因为朱慈烺的到来，除了高杰之外，都没了所谓的拥护之功，同样也就没了原本的威风，加上朱慈烺麾下大军的威慑，现在如今一个比一个乖，都在等待朝廷的安排。
朱慈烺根据当前的局势和江北各部的实力，在驻防地上，稍稍做了一些改变。
四镇中实力最为强悍的高杰所部，驻扎在凤阳府北面的州县，以及徐州府，手下兵马较强，也忠心耿耿的黄得功被分配在了淮安府，两人互为犄角，结成江北的第一道防线，抵御来自北面的敌人。
而刘泽清则是调到了驻守庐州府，同时分兵凤阳府西南，暂任凤阳总兵的陈福领着兼并了路振飞巡抚标营和凤阳标营的一个新营，两人共同防范来自河南方面的敌人，甚至刘泽清部署在凤阳府的那支兵马，必要时候，也要接受陈福的指挥。
至于巡抚淮扬的路振飞，此时则是负责统一供应江北各部大军粮草，协调民夫，修缮各州府城防，同时督粮各地民兵。
而实力最弱，原本历史上还直接率麾下大军投降的刘良佐，则是被调到了江南的镇江府，名义上自然是为了更好的给他补充兵员，恢复实力。
至于扬州府，应天府，则成了殿前军的驻防地，这支兵马已经初具规模，而且有了基本训练，朱慈烺打算亲自统领，此时由已经成为京营营官的常登贵，暂时领着训练。