时光悠悠，两千年匆匆而过。
这两千年，菌文明一直未对神舟文明发动直接的攻击，但思维渗透的越来越强烈，甚至已经侵蚀到了各自文明的认知体系，这种入侵无声无息，却比任何武器都更为致命。
希恩斯曾试图以“思维感染屏蔽器”抵御这股无形的洪流，后更名为“心灵防火墙”计划，然而，终究未能如愿，宣告破产。
雷迪亚兹的两千年苦守，也未能寻得一丝追踪菌文明的线索，现有的技术理论，也没有找到可以追踪菌文明的方法，甚至连方向都没有。神舟文明眼前只有无尽迷雾，一切都被笼罩其中。
罗辑也曾发布过黑暗森林新论，认为这是打破黑暗森林的最后一战，这是黎明前最后的黑暗。
若在此刻放弃，那将是对未来无尽的遗憾。这个宇宙是黑暗的，更黑暗的是我们放弃了我们的奋斗目标。
人类曾经战胜三体，有的只是一个简单的信念：凡是三体人阻止我们的，那就说明我们是在正确的成功道路上。
如今，宇宙同样在考验我们，这恰恰证明，我们依然行走在正确的道路上。
然而，无法叫醒一个装睡的人，也无法改变一个文明的心态。对于许多文明而言，罗辑的新论犹如一碗高高在上的“鸡汤”，虽能激发一时的热情，却无法真正解决他们面临的困境。
在菌文明的高维意识入侵下，他们饱受精神干扰，情绪暴躁、焦虑、偏激，思维变得迟钝，自我怀疑如毒蛇般啃噬着他们的心灵，他们随时会做出异常的行为。
他们质疑自己的记忆、情感乃至存在的意义，真实与虚幻的界限变得模糊，内心的冲突与挣扎让他们痛苦不堪，仿佛随时都会崩溃。
社会的动荡如影随形，信任危机如瘟疫般蔓延，人际关系变得脆弱而复杂。人们相互猜疑，内部的冲突与分裂如野火燎原，无法遏制。这种社会的不稳定，无疑加剧了文明体的困境，让他们陷入了前所未有的危机之中。
以现在他们的文明等级及技术，能够展现出超乎想象的伟力。
例如，已经可以脱离的身体的束缚，成为实体与非实体之间的存在。膜文明神舟已经完成了纯能化，他们身体完全是能量化的存在，他们覆手之间就可以摧毁一颗恒星系。
然而，即便如此强大如此，他们却也始终无法突破最终的禁区，即思维意识领域。
即使如歌者一样将自己改造成二维生物，他们的意识体还是在高维，仍是他们难以企及的高等。甚至维度越低，他们距离他们的高维的意识就越远。
这一切的一切，都在无情地加剧着神舟文明的绝望情绪。他们仿佛被困在了一个无形的牢笼之中，无法逃脱，甚至都无法挣扎。
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林森这两千年也布局了无数的计划，即便是如神舟这般达到宇宙之巅的超级文明，凭借其无与伦比的智慧与庞大的计算能力，在面对林森那如迷雾般复杂的策略时，也仍然无法参破。
但随之神舟中也有无数的声音对林森表示质疑，尤其是后期加入的文明。
在他们眼中，林森引领弱小的人类战胜强大三体的事迹，简直不可思议，违背了宇宙间力量对比的常识。他们总能找到无数的“证据”证明其不合理，认为这一切不过是人类与三体等文明联手编织的一场惊天“骗局”。
人类的目的就是让附属文明对他们产生精神崇拜，这也与菌文明的思维入侵本质没什么区别。
他们认为，自己能够达到如今的文明高度，无不是历经了数亿年的漫长岁月，期间经历了无数次灾难的洗礼与危机的考验，每一步都充满了血与泪的奋斗。
相比之下，人类与三体等文明仅在短短的几十万年里，便实现了如此惊人的飞跃，这在他们看来，实在太过匪夷所思，难以令人信服。