在经历了上述两场生与死的考验后，普京的忠诚让索布恰克深受感动，普京的沉着镇定和处变不惊的能力让他对普京更为器重。他坚定地认为普京是自己人。他甚至公开表示，普京是绝对可以信赖的人。
1992年，普京出任主管对外经济联系的副市长，负责管理外国代表机构、旅馆、赌场、社会团体以及强力部门，同时还负责大型投资项目。1994年3月，索布恰克将普京提升为圣彼得堡市第一副市长并兼任对外联络委员会主席。这时，普京对索布恰克的影响已相当深。无论是在任市政府对外联络委员会主席期间，还是在副市长的工作岗位上，普京都取得了突出的工作成绩。尤其是圣彼得堡市的经济工作在他的领导下得到了很大的发展。
在他的直接领导下，圣彼得堡市迅速建立起了外汇市场，并成功地与其他许多国外银行和大企业签署了引进外资、合资、合作建厂的协议书。特别是在国外工作期间结识的老朋友帮助下，使得包括德累斯顿银行在内的许多的德国知名大公司、大企业源源不断地进入圣彼得堡，设立办事处或分支机构。
联邦副总理丘拜斯在领导实施私有化改革时，多次和负责圣彼得堡经济的普京打交道。丘拜斯后来回忆说，普京虽然不是学经济的，但是对复杂的经济问题领悟得很快。
普京的政绩也引来反对派的攻击，他们以普京为克格勃工作过为由，企图将他从索布恰克身边赶走。但索布恰克公开批驳了这些要求，他说：首先，普京不是克格勃的人，他是我的学生。其次，普京曾从事对外情报工作，是在保卫国家利益。他没有什么可为自己的工作感到羞愧的。可以说，索布恰克的这些告白完全发自内心，对普京的心理帮助很大，同时更加激发了他对工作的热情和对索布恰克的忠心。